ツーバイフォー住宅は、地震の揺れを6面体の建物全体で受け止めて力を分散させます。地震力が一部分に集中することがないため倒壊・損傷がなく、地震に対して抜群の強さを発揮します。2011年に起きた東日本大震災では、補修をしなくとも居住に支障のない住宅は95%にあたり、高い耐震性が実証されました。（詳細はこちら）

ツーバイフォー住宅では、構造用製材に含水率19％以下の日本農林規格（JAS）に基づく乾燥材を使用しています。また、壁内に断熱材が充填されているため、室外と室内の温度差がゆるやかに緩和され、結露が発生しにくい構造となっています。この構造によって、木材の腐朽やカビの繁殖などを防ぎます。

ツーバイフォー住宅では、すべての天井や壁の内側全面に、厚さ12.5mm以上の石こうボードが貼られます。石こうボードの中には約21％の結晶水が含まれていて、炎があたると熱分解を起こして約20分もの間、水蒸気を放出するという優れた特性を発揮します。このため火災が発生しても、天井裏や壁の内部の温度が上昇しにくく、構造材が発火点（約450℃）に達するまでの時間を大きく遅らせることができます。
さらに、火の通り道となる床や壁の内側において、枠組材などがファイヤーストップ材となって空気の流れを遮断し、上階へ火が燃え広がるのをくい止めます。

ツーバイフォー住宅は、断熱性や気密性に優れ、冷暖房効率が高いのが特徴です。外壁は枠組材に構造用面材を貼った大壁構造のため、枠組材の間に空気層をつくります。また、断熱材はその空気層に充填するため施工も容易です。構造体自体を断熱化し易く、気密施工も容易なために建物自体がもともと優れた断熱性・気密性を兼ね備えています。